跳转至内容
武汉生命之美科技有限公司
ABLIFE translate sequences to science and application
武汉生命之美科技有限公司武汉生命之美科技有限公司
  • 首页
  • 科技服务
    • 测序平台介绍
      • Hiseq3000/4000
      • HiSeq 2000 / 2500
      • NextSeq500
      • PacBio RS
    • 功能基因组平台
      • 转录组测序(RNA-seq)
      • 小RNA测序(miRNA-seq)
      • 加帽端测序(CAGE-seq)
      • 多聚腺苷化位点测序(PAS-seq)
      • 多聚腺苷化长度测序(Poly(A)-seq)
      • 环状RNA测序(CircRNA-seq)
      • 6-甲基腺嘌呤RNA测序(MeRIP-seq )
      • 宏转录组(Metatranscriptome)
      • CRISPR/Cas9
    • RNA-蛋白质互作组平台
      • RNA结合蛋白免疫沉淀结合高通量测序(RIP-seq)
      • 紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(CLIP-seq)
      • RAP
      • ChIRP
      • mRNA Interactome Capture
    • 表观遗传学平台
      • 染色质免疫共沉淀结合高通量测序(ChIP-seq)
      • 亚硫酸盐测序(BS-seq)
    • 基因组平台
      • 基因组重测序(Genome Resequencing)
      • 宏基因组测序(Metagenomic Sequencing)
      • 基因组从头测序(De novo Genome Sequencing)
      • 外显子组测序(Exome Sequencing)
  • RBP数据包产品
    • RBP沉默数据包
    • RBP过表达数据包
    • RBP质粒产品
      • shRNA质粒
      • 过表达质粒
    • RBP基因数据包产品列表
  • 单细胞产品
    • 技术简介
    • 服务内容
    • 文章案例
  • 行业前沿
    • 抗击新冠病毒
  • 关于我们
    • 公司简介
    • 专家团队
    • 公司动态
    • ABLife支持文章
    • 加入我们
    • 联系我们
 
  • 首页
  • 科技服务
    • 测序平台介绍
      • Hiseq3000/4000
      • HiSeq 2000 / 2500
      • NextSeq500
      • PacBio RS
    • 功能基因组平台
      • 转录组测序(RNA-seq)
      • 小RNA测序(miRNA-seq)
      • 加帽端测序(CAGE-seq)
      • 多聚腺苷化位点测序(PAS-seq)
      • 多聚腺苷化长度测序(Poly(A)-seq)
      • 环状RNA测序(CircRNA-seq)
      • 6-甲基腺嘌呤RNA测序(MeRIP-seq )
      • 宏转录组(Metatranscriptome)
      • CRISPR/Cas9
    • RNA-蛋白质互作组平台
      • RNA结合蛋白免疫沉淀结合高通量测序(RIP-seq)
      • 紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(CLIP-seq)
      • RAP
      • ChIRP
      • mRNA Interactome Capture
    • 表观遗传学平台
      • 染色质免疫共沉淀结合高通量测序(ChIP-seq)
      • 亚硫酸盐测序(BS-seq)
    • 基因组平台
      • 基因组重测序(Genome Resequencing)
      • 宏基因组测序(Metagenomic Sequencing)
      • 基因组从头测序(De novo Genome Sequencing)
      • 外显子组测序(Exome Sequencing)
  • RBP数据包产品
    • RBP沉默数据包
    • RBP过表达数据包
    • RBP质粒产品
      • shRNA质粒
      • 过表达质粒
    • RBP基因数据包产品列表
  • 单细胞产品
    • 技术简介
    • 服务内容
    • 文章案例
  • 行业前沿
    • 抗击新冠病毒
  • 关于我们
    • 公司简介
    • 专家团队
    • 公司动态
    • ABLife支持文章
    • 加入我们
    • 联系我们

多聚腺苷化长度测序(Poly(A)-seq)

  • 技术简介
  • 服务内容
  • 文章导读

技术简介

Poly(A)-seq (Poly(A)-tail length profiling by sequencing),即Poly(A) 尾长度测序,该技术能够在全基因组水平上测量poly(A)尾巴的长度。大多数真核mRNA的3′非翻译区域下游含有一个非模板化的poly(A)尾巴,这个尾巴有助于mRNA的稳定和向细胞质内的运输。poly(A)尾巴长度会影响mRNA的翻译效率,因此,Poly(A)-seq可以作为一种潜在工具去解析mRNA降解和翻译的动态调控过程,也能够发现一些RNA裂解和加尾的未知特点。

服务内容


1.PolyA-seq建库流程

http://114.115.208.242/wp-content/uploads/2014/09/polyA-1024x951.png

2.PolyA-seq分析流程

http://114.115.208.242/wp-content/uploads/2014/09/RNA-seq-workflow-no-ref-v2.2-609x1024.png

3.PolyA-seq分析结果展示

http://114.115.208.242/wp-content/uploads/2014/09/polyA-seq-A%E9%9D%9E%E6%B4%B2%E7%88%AA%E8%9F%BE%E4%B8%8D%E5%90%8C%E5%8F%91%E8%82%B2%E6%97%B6%E6%9C%9FpolyA%E9%95%BF%E5%BA%A6%E7%9A%84%E5%8F%98%E5%8C%96%EF%BC%9BB%EF%BC%8C%E5%8D%95%E5%9F%BA%E5%9B%A0polyA%E9%95%BF%E5%BA%A6%E5%88%86%E5%B8%83%E5%9B%BE-1024x405.png

文章导读

Regulation of Poly(A) Tail and Translation during the Somatic Cell Cycle

Regulation of Poly(A) Tail and Translation during the Somatic Cell Cycle

2016年7月4日

V. Narry Kim实验室于2014年开发了可用于高通量检测Poly(A)尾巴长度的TAIL-seq技术,并发现在胚胎细胞以外Poly(A)尾巴长度和翻译效率并无明显的线性相关关系。现在该实验室的研究者们利用TAIL-seq和核糖体分析(ribosome profiling)技术,分析细胞周期中Poly(A)尾巴长度和翻译调控的关系。

IVT-seq reveals extreme bias in RNA sequencing

IVT-seq reveals extreme bias in RNA sequencing

2015年11月16日

宾夕法尼亚大学的研究者们最近使用了一项新技术来检测在RNA-seq建库和测序过程中人为引入的偏好。高通量RNA测序技术已称为基因表达和转录组分析的重要手段,但人们对不同的建库方法引入的偏好(bias)了解不足,迄今为止也没有好的手段来估算这种偏好。John B. Hogenesch的研究团队展示了通过体外转录组测序(in vitro transcription seq,IVT-seq)估算偏差的方法,可能为今后的实验设计和方法改进提供参考。

Dynamic analyses of alternative polyadenylation from RNA-seq reveal a 3’-UTR landscape across seven tumour types

Dynamic analyses of alternative polyadenylation from RNA-seq reveal a 3’-UTR landscape across seven tumour types

2015年11月13日

可变聚腺苷酸化(alternative polyadenylation, APA)是转录后水平调控的重要组成部分。约70%的人类基因都有多个polyA位点,可以产生长度不同的3′-UTR或transcript variant,极大提高了转录组的多样性。最近的研究显示肿瘤组织也有其独特的APA特征,如形成较短的3′-UTR,但人们对其的认识还远远不够充分。贝勒医学院Wei Li研究团队在Nature Communication上报道使用一种新的生物信息学算法DaPars(Dynamic analysis of Alternative PolyAdenylation from RNA-Seq)重新分析了现有的肿瘤组织RNA-seq数据,他们发现的肿瘤组织APA特征可能为癌症诊断提供新的方法。

mRNA poly(A)长度不影响翻译效率

mRNA poly(A)长度不影响翻译效率

2014年9月2日

Subtelny等研究人员发表了题为“Poly(A)-tail profiling reveals an embryonic switch in translational control poly(A)”的文章,通过PAL-seq (poly(A)-tail profiling by sequencing) 技术研究了胚胎发育时期poly(A)尾巴长度与翻译效率的关系。相关成果公布在2014年1月29日Nature杂志上。

 我用菊子曰写博客,你呢?
  • 测序平台介绍
    • GA
    • HiSeq 2000 / 2500
    • NextSeq500
    • PacBio RS
  • 功能基因组产品
    • 转录组测序
    • 小RNA测序
    • CAGE-seq
    • PAS-seq
    • Poly(A)-seq
    • CircRNA-seq
    • MeRIP-seq
    • Metatranscriptome
    • CRISPR/Cas9
  • RNA-蛋白质互作组产品
    • RIP-seq
    • CLIP-seq
    • ChIRP
    • RAP
    • mRNA Interactome Capture
  • 表观遗传学产品
    • BS-seq
    • ChIP-seq
  • 基因组产品
    • Genome Resequencing
    • Metagenomic Sequencing
    • De novo Genome Sequencing
    • Exome Sequencing
关于生命之美

武汉生命之美科技有限公司成立于2010年7月,是一家专注于将高通量测序技术(NGS)转化为科学发现和产业应用的生物高科技企业。生命之美使用新一代测序技术和RNA-蛋白质互作的科学技术优势,短短数年时间,就成长为一个拥有强大实验室和科研实力的合作平台。生命之美不但已经与各高校、研究所的实验室一起合作science,也启动了与普通大众一起science的模式,希望以健康产品服务每一名个体。生命之美为爱和梦想而来,它期待着与中国、一带一路各国乃至全球的伙伴们一起做一个前所未有的科学梦:用科学祝福全球!

武汉生命之美科技有限公司

公司动态
  • 热烈祝贺生命之美CEO张翼博士荣获省级荣誉
    2020年10月26日
  • 生命之美与华农赵凌课题组合作文章发表于Genome Biology
    2020年9月17日
  • 生命之美与上交大团队合作文章发表于PLoS Pathogens
    2020年9月17日
主要业务
  • 科技服务
  • RBP产品
武汉生命之美科技有限公司
© 2010-2020 武汉生命之美科技有限公司 版权所有 ICP证: 鄂ICP备14011369号-1
ABLIFE Translates Sequences to Science and Industry