跳转至内容
武汉生命之美科技有限公司
ABLIFE translate sequences to science and application
武汉生命之美科技有限公司武汉生命之美科技有限公司
  • 首页
  • 科技服务
    • 测序平台介绍
      • Hiseq3000/4000
      • HiSeq 2000 / 2500
      • NextSeq500
      • PacBio RS
    • 功能基因组平台
      • 转录组测序(RNA-seq)
      • 小RNA测序(miRNA-seq)
      • 加帽端测序(CAGE-seq)
      • 多聚腺苷化位点测序(PAS-seq)
      • 多聚腺苷化长度测序(Poly(A)-seq)
      • 环状RNA测序(CircRNA-seq)
      • 6-甲基腺嘌呤RNA测序(MeRIP-seq )
      • 宏转录组(Metatranscriptome)
      • CRISPR/Cas9
    • RNA-蛋白质互作组平台
      • RNA结合蛋白免疫沉淀结合高通量测序(RIP-seq)
      • 紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(CLIP-seq)
      • RAP
      • ChIRP
      • mRNA Interactome Capture
    • 表观遗传学平台
      • 染色质免疫共沉淀结合高通量测序(ChIP-seq)
      • 亚硫酸盐测序(BS-seq)
    • 基因组平台
      • 基因组重测序(Genome Resequencing)
      • 宏基因组测序(Metagenomic Sequencing)
      • 基因组从头测序(De novo Genome Sequencing)
      • 外显子组测序(Exome Sequencing)
  • RBP数据包产品
    • RBP沉默数据包
    • RBP过表达数据包
    • RBP质粒产品
      • shRNA质粒
      • 过表达质粒
    • RBP基因数据包产品列表
  • 单细胞产品
    • 技术简介
    • 服务内容
    • 文章案例
  • 行业前沿
    • 抗击新冠病毒
  • 关于我们
    • 公司简介
    • 专家团队
    • 公司动态
    • ABLife支持文章
    • 加入我们
    • 联系我们
 
  • 首页
  • 科技服务
    • 测序平台介绍
      • Hiseq3000/4000
      • HiSeq 2000 / 2500
      • NextSeq500
      • PacBio RS
    • 功能基因组平台
      • 转录组测序(RNA-seq)
      • 小RNA测序(miRNA-seq)
      • 加帽端测序(CAGE-seq)
      • 多聚腺苷化位点测序(PAS-seq)
      • 多聚腺苷化长度测序(Poly(A)-seq)
      • 环状RNA测序(CircRNA-seq)
      • 6-甲基腺嘌呤RNA测序(MeRIP-seq )
      • 宏转录组(Metatranscriptome)
      • CRISPR/Cas9
    • RNA-蛋白质互作组平台
      • RNA结合蛋白免疫沉淀结合高通量测序(RIP-seq)
      • 紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(CLIP-seq)
      • RAP
      • ChIRP
      • mRNA Interactome Capture
    • 表观遗传学平台
      • 染色质免疫共沉淀结合高通量测序(ChIP-seq)
      • 亚硫酸盐测序(BS-seq)
    • 基因组平台
      • 基因组重测序(Genome Resequencing)
      • 宏基因组测序(Metagenomic Sequencing)
      • 基因组从头测序(De novo Genome Sequencing)
      • 外显子组测序(Exome Sequencing)
  • RBP数据包产品
    • RBP沉默数据包
    • RBP过表达数据包
    • RBP质粒产品
      • shRNA质粒
      • 过表达质粒
    • RBP基因数据包产品列表
  • 单细胞产品
    • 技术简介
    • 服务内容
    • 文章案例
  • 行业前沿
    • 抗击新冠病毒
  • 关于我们
    • 公司简介
    • 专家团队
    • 公司动态
    • ABLife支持文章
    • 加入我们
    • 联系我们

Dynamic analyses of alternative polyadenylation from RNA-seq reveal a 3’-UTR landscape across seven tumour types

1.文章简介

文章题目 Dynamic analyses of alternative polyadenylation from RNA-seq reveal a 3’-UTR landscape across seven tumour types
中文题目
期刊名
作者
发表时间 2015
实验材料
测序平台
相关产品 Poly(A)-seq

可变聚腺苷酸化(alternative polyadenylation, APA)是转录后水平调控的重要组成部分。约70%的人类基因都有多个polyA位点,可以产生长度不同的3′-UTR或transcript variant,极大提高了转录组的多样性。最近的研究显示肿瘤组织也有其独特的APA特征,如形成较短的3′-UTR,但人们对其的认识还远远不够充分。贝勒医学院Wei Li研究团队在Nature Communication上报道使用一种新的生物信息学算法DaPars(Dynamic analysis of Alternative PolyAdenylation from RNA-Seq)重新分析了现有的肿瘤组织RNA-seq数据,他们发现的肿瘤组织APA特征可能为癌症诊断提供新的方法。
该团队的研究者们重点分析了七类肿瘤的APA特征,包括膀胱尿路上皮癌,头颈部鳞状细胞癌,肺腺癌,乳腺癌,肾透明细胞癌和子宫内膜癌。在肿瘤发生过程中他们一共鉴定出了1346种肿瘤组织APA特征,其中大部分导致3′-UTR缩短和基因表达上调。受影响的基因可富集到多条已知的肿瘤调控信号通路中,其中GLS(glutaminase) 基因的表达上调也受APA调控。GLS的高表达可提供癌细胞分裂所需的能量供应,是肿瘤发生的标志之一。研究者们认为,他们在这篇文章中描述的肿瘤组织APA特征,包括GLS的APA特征,可为多种癌症的预后诊断提供依据。
http://114.115.208.242/wp-content/uploads/2015/11/CAGE_polyA-778x1024.png

原文出处:

Alarcón C R, Hyeseung L, Hani G, et al. N6-methyladenosine marks primary microRNAs for processing.[J]. Nature, 2015, 519(7544):482-5.

菊子曰 菊子曰:一键秒发的日志发布工具!
Category: CNS-Reading2015年11月13日
标签: PolyA
联系咨询






关于生命之美

武汉生命之美科技有限公司成立于2010年7月,是一家专注于将高通量测序技术(NGS)转化为科学发现和产业应用的生物高科技企业。生命之美使用新一代测序技术和RNA-蛋白质互作的科学技术优势,短短数年时间,就成长为一个拥有强大实验室和科研实力的合作平台。生命之美不但已经与各高校、研究所的实验室一起合作science,也启动了与普通大众一起science的模式,希望以健康产品服务每一名个体。生命之美为爱和梦想而来,它期待着与中国、一带一路各国乃至全球的伙伴们一起做一个前所未有的科学梦:用科学祝福全球!

武汉生命之美科技有限公司

公司动态
  • 热烈祝贺生命之美CEO张翼博士荣获省级荣誉
    2020年10月26日
  • 生命之美与华农赵凌课题组合作文章发表于Genome Biology
    2020年9月17日
  • 生命之美与上交大团队合作文章发表于PLoS Pathogens
    2020年9月17日
主要业务
  • 科技服务
  • RBP产品
武汉生命之美科技有限公司
© 2010-2020 武汉生命之美科技有限公司 版权所有 ICP证: 鄂ICP备14011369号-1
ABLIFE Translates Sequences to Science and Industry