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Neuronal subtypes and diversity revealed by single-nucleus RNA sequencing of the human brain

Edited By:尹岚博士

1.文章简介

文章题目 Neuronal subtypes and diversity revealed by single-nucleus RNA sequencing of the human brain
期刊名 Science IF:34.661
发表时间 2016.06
单位 University of California, San Diego
实验材料 neuronal nuclei from the postmortem brain of a normal, 51-year-old female
测序平台 single-nucleus RNA sequencing pipeline
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2.研究背景

对单个人类大脑神经元细胞核进行单细胞核转录组测序能够高效鉴定人类大脑神经性元不同亚型,奠定“绘制”人类脑神经元细胞基因活性方法的基础。同时,可以帮助我们更好理解人脑正常功能及疾病异常,包括阿尔茨海默氏症、帕金森症、精神分裂症和抑郁症等。

3.研究方法

四个研究团队合作开发了一个全新的基于细胞核RNA测序的技术平台。由神经学教授Jerold Chun 领导的Scripps研究所(TSRI)团队负责分离、提取单个脑神经元细胞核;张鹍教授团队在Fluidigm(单细胞研究及微流控芯片制造商)支持下,开发了单个神经元细胞核RNA扩增以及文库构建的流程;Illumina公司范建兵团队负责RNA文库的测序;UCSD生物化学系王巍教授团队开发了相应算法,负责测序数据的分析。
研究思路
通过分离和对单个人类大脑神经元细胞核进行单细胞核转录组测序,在人脑的六个高级功能区确定16种神经元亚型。
文章亮点
个体人脑细胞是独一无二的,这些细胞表达不同基因,承担不同功能。通过对单个人类大脑神经元细胞核进行单细胞核转录组测序,在人脑的六个高级功能区确定16种神经元亚型。
利用基于细胞核RNA测序的技术平台,可以构建人脑细胞“参考图谱”,作为理解正常健康大脑与异常疾病大脑的基础。

4.研究成果

1.对单个人类大脑神经元细胞核进行单细胞核转录组测序,在人脑的六个高级功能区确定16种神经元亚型。
2.中间神经元的8个亚型
3.兴奋性神经元亚型显示空间特异性

原文出处:

Blue L, Rizi A, Gwendolyn K, et al., 2016.Neuronal subtypes and diversity revealed by single-nucleus RNA sequencing of the human brain. Science, 352(6293):1586-1590.

 

菊子曰 菊子曰:支持各大博客网站的博客群发工具!
Category: CNS-Reading2016年7月4日
标签: RNA-seq
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