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DNA Methylation on N6-Adenine in C. elegans.

1.文章简介

文章题目 DNA Methylation on N6-Adenine in C. elegans.
中文题目
期刊名
作者
发表时间 2015
实验材料
测序平台
相关产品 MeRIP-Seq

在哺乳动物中,发生在胞嘧啶第5位碳原子上的DNA甲基化(5mC),是非常重要的表观遗传标记,而线虫中由于检测不到5mC 和胞嘧啶DNA甲基转移酶同源物而被认为缺乏DNA的甲基化。但是来自哈佛医学院的Eric Greer教授和施扬教授的研究发现,利用MeDIP-Seq和SMRT-seq相结合,检测到线虫的DNA中存在甲基化的腺嘌呤(6mA),而且在组蛋白去甲基酶(spr-5)功能缺失的线虫中,随着生育能力一代代下降6mA的水平增高。在鉴别出调控6mA的DNA去甲基化酶后,研究人员证实除去组蛋白和DNA去甲基化酶都可以加快跨代生育能力丧失的步伐,表明6mA和组蛋白甲基化有可能协同作用传递了遗传信息。
利用MeDIP-Seq,在野生型线虫中,共检测到766个DNA 6mA的结合峰(peak),并在314个结合峰中检测到AGAAGAAGAAGA基序。
http://114.115.208.242/wp-content/uploads/2015/11/MeDIP.png

左图为MeDIP-seq的结果展示,右图为SMRT-seq的结果展示

MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,甲基化DNA免疫共沉淀测序)是基于抗体富集原理进行全基因组甲基化检测的高通量测序方法,采用甲基化DNA免疫共沉淀技术,通过6-甲基腺嘌呤(anti-6mA)抗体特异性富集基因组上发生甲基化的DNA片段,然后通过高通量测序快速有效地寻找基因组上发生6mA的区域。

原文出处:

Greer EL, Blanco MA, Gu L,等. DNA Methylation on N(6)-Adenine in C. elegans.[J]. Cell, 2015, 161(4).

菊子曰 菊子曰:我在用着的博客编辑软件
Category: CNS-Reading2015年11月13日
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武汉生命之美科技有限公司成立于2010年7月,是一家专注于将高通量测序技术(NGS)转化为科学发现和产业应用的生物高科技企业。生命之美使用新一代测序技术和RNA-蛋白质互作的科学技术优势,短短数年时间,就成长为一个拥有强大实验室和科研实力的合作平台。生命之美不但已经与各高校、研究所的实验室一起合作science,也启动了与普通大众一起science的模式,希望以健康产品服务每一名个体。生命之美为爱和梦想而来,它期待着与中国、一带一路各国乃至全球的伙伴们一起做一个前所未有的科学梦:用科学祝福全球!

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