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Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency.

1.文章简介

文章题目 Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency
中文题目
期刊名 Nature IF:38.138
作者
发表时间 2014
实验材料
测序平台
相关产品 Circular-RNA

Circular RNA是mRNA剪接的特殊产物,是一类具有潜在重要调控功能的RNA。但到目前为止,人体内究竟有多少种circular RNA,这些circular RNA究竟有什么生物学功能,还是一个有待研究的问题。最近,Nature杂志发表了一篇题为“Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency”的文章,对任何小鼠体内的circular RNA进行了系统鉴定,并对其可能的生物学功能进行了研究。

研究人员首先将总RNA中的rRNA去掉,然后使用一个核酸外切酶将线性的RNA降解掉,在对剩余的不被切割的circular RNA进行建库和高通量测序,在人类RNA中鉴定出了1950个环形RNA,并使用实验的手段对其中的部分circular RNA进行了验证。这些circular RNA具有很强的组织特异性表达,暗示这些RNA具有重要的调控功能。

为了揭示circular RNA的调控功能,研究人员对circular RNA上microRNA结合位点的分布情况进行了统计,发现相对于编码mRNA和3’UTR,circular RNA上显著富集microRNA的结合位点。暗示对microRNA的调控可能是circular RNA的功能之一。

进而研究人员对其中的一个circular RNA,CDR1as的调控功能进行了深入研究。CDR1as上具有74个miR-7的结合位点,使用Ago2-clip的方法,作者对miR-7对CDR1as的结合进行了研究。结果表明,miR-7在CDR1as上具有很强的结合,说明CDR1as可能充当了miR-7的海绵。为了进一步确认CDR1as对miR-7调控的存在,研究人员降低了体内CDR1as的含量从而释放CDR1as对miR-7的抑制,发现miR-7的靶标mRNA都被下调了,证实CDR1as对miR-7的调控是真实存在的。同时研究人员还发现CDR1as与miR-7倾向于在神经组织中共同高表达,但在其他非神经组织中却无此相关性,这暗示CDR1as可能在神经组织中特异调控miR-7的活性。
http://114.115.208.242/wp-content/uploads/2014/09/Circular-RNAs-are-a-large-class-of-animal-RNAs-with-regulatory-potency.stability2.jpg

 

原文出处:

Memczak S, Jens M, Elefsinioti A, Torti F, Krueger J, Rybak A, Maier L, Mackowiak SD, Gregersen LH, Munschauer M et al (2013) Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency. Nature 495:333-338.

菊子曰 我用菊子曰写博客,你呢?
Category: CNS-Reading2014年9月4日
标签: Circular-RNA
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